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編碼多肽或蛋白的lncRNA和circRNA

技術簡介

越來越多的研究表明,有的lncRNA和circRNA也能編碼多肽或蛋白;且部分多肽還具有重要生理功能。為系統研究具有多肽或蛋白編碼功能的lncRNA或circRNA,我公司制定了能快速準確篩選它們及探究其產物功能的個性化解決方案。該技術的基本思路是:編碼蛋白的RNA有開放閱讀框(ORF),翻譯時會與核糖體結合,產生對應的多肽或蛋白產物,通過分離核糖體-RNA復合物,對RNA進行測序,lncRNA/circRNA分析,ORF預測,可以預測其編碼的多肽或蛋白信息;之后分離樣本中的蛋白質進行質譜測定,獲得實際的多肽或蛋白信息;將以上兩種信息進行匹配,即可篩選到具有多肽或蛋白編碼功能的lncRNA/circRNA信息。

應用領域


編碼多肽或蛋白的lncRNA和circRNA研究。

技術優點


可以從一次性獲得很多編碼多肽或蛋白的lncRNA和circRNA信息,為后續研究鑒定基礎。


技術流程


輝駿生物;編碼多肽或蛋白的lncRNA和circRNA技術流程



參考文獻


1.A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance. Cell 160(4):595-606 (2015). [IF>30]

2.A peptide encoded by a transcript annotated as long noncoding RNA enhances SERCA activity in muscle. Science 351(6270):271-275 (2016). [IF>30]

3.Circ-ZNF609 Is a Circular RNA that Can Be Translated and Functions in Myogenesis. Mol Cell 66(1):22-37 e29 (2017). [IF>15]

4.Translation of CircRNAs. Mol Cell 66(1):9-21 e27 (2017). [IF>14]

5.Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine. Cell Res 27(5):626-641 (2017). [IF>15]

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