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代謝組:LC/GC-MS

技術簡介

代謝組是指在特定生理時期或處理條件下,某一生物體或細胞內包含的所有低分子量(<1000Da)代謝產物。代謝組學是對這些產物進行定性和定量分析的科學。

代謝組學研究按照研究目的可分為非靶向代謝組學和靶向代謝組學。非靶向代謝組學是對生物體內源性代謝物進行系統全面的分析,以尋找差異代謝物(代謝譜分析);靶向代謝組學則是針對特定的某一類代謝物進行分析。

目前常用的代謝組學研究方法有:液相色譜-質譜聯用(LC-MS)、氣相色譜-質譜聯用(GC-MS)等。



應用領域


疾病診斷、藥物代謝機理及毒理研究、動植物抗病抗逆機理研究等。



技術流程(非靶向代謝)


代謝物提取——代謝物衍生化(GC-MS需要)——上機檢測——數據統計分析——差異代謝物篩選——KEGG pathway分析

輝駿生物:非靶向代謝技術流程



技術特點


1. LC-MS法靈敏度較高,較寬動態范圍,無需衍生化,更適用于分析難揮發或熱穩定性差的代謝物;缺點是標準譜圖庫信息不全,不易定性。


2. GC-MS法分辨率高,靈敏度高,有比較標準的數據庫,易于定性,可檢測樣本中大多數有機和部分無機分子;缺點是需要衍生化,預處理繁瑣。


參考文獻


1.Metabolomic analysis of the effects of cadmium and copper treatment in Oryza sativa L. using untargeted liquid chromatography coupled to high resolution mass spectrometry and all-ion.

2.fragmentation. Metallomics.9(6):660-675(2017).

3.Metabolic biomarker signature to differentiate pancreatic ductal adenocarcinoma from chronic pancreatitis. Gut, pii: gutjnl-2016-312432 (2017).

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